Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Saa4P31532 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Saa4P31532 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms