Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PrkcdP28867 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcdP28867 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms