Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BgnP28653 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms