Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tap1P21958 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tap1P21958 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms