Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SftpcP21841 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SftpcP21841 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms