Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NelfeP19426 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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NelfeP19426 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NelfeP19426 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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