Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NefhP19246 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NefhP19246 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NefhP19246 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NefhP19246 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NefhP19246 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NefhP19246 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms