Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P18526 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P18526 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P18526 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P18526 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P18526 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P18526 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms