Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18525 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18525 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P18525 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P18525 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P18525 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms