Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tgfb3P17125 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgfb3P17125 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms