Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms