Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd4P10628 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms