Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdh3P10287 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh3P10287 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms