Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprqP0C5E4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprqP0C5E4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms