Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JtbO88824 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JtbO88824 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JtbO88824 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JtbO88824 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
JtbO88824 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JtbO88824 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms