Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cops4O88544 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops4O88544 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms