Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capns1O88456 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Capns1O88456 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns1O88456 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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