Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gfi1bO70237 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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