Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SlkO54988 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SlkO54988 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SlkO54988 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms