Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NlkO54949 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NlkO54949 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NlkO54949 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NlkO54949 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NlkO54949 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NlkO54949 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NlkO54949 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NlkO54949 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NlkO54949 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NlkO54949 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NlkO54949 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms