Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab33bO35963 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab33bO35963 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab33bO35963 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab33bO35963 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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