Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Xbp1O35426 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms