Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Nedd9O35177 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd9O35177 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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