Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckarO08786 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckarO08786 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckarO08786 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckarO08786 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckarO08786 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms