Protein–RNA interactions for Protein: L7N271

Gm7970, Predicted gene 7970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7970L7N271 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm7970L7N271 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7970L7N271 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms