Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms