Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34aG3UW52 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms