Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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