Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm28048F7BCN0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Gm28048F7BCN0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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