Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Krt78E9Q0F0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms