Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms