Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms