Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms