Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11127A7VMS2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms