Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn6A2AJB9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Lcn6A2AJB9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Lcn6A2AJB9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn6A2AJB9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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