Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhbdl2A2AGA4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms