Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprfA2A8L5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprfA2A8L5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms