Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkd2l1A2A259 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd2l1A2A259 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms