Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam71e1A1L3C1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms