Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930469K13RikA0A286YDB2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930469K13RikA0A286YDB2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms