Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms