Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms