Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtpreP49446 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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PtpreP49446 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtpreP49446 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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PtpreP49446 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PtpreP49446 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtpreP49446 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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