Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP000820.1-201ENST00000545912 506 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PLA2G1B-203ENST00000549767 562 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC109597.1-201ENST00000564016 786 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.176-201ENST00000619772 282 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC092329.4-205ENST00000638822 574 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RBMS2-204ENST00000550726 1452 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TLK2P2-201ENST00000414066 2240 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L26-202ENST00000610514 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L20-202ENST00000613757 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L11-202ENST00000613973 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L19-202ENST00000615989 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L18-202ENST00000619296 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L25-202ENST00000621472 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 USP17L24-202ENST00000622713 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RBMS3-203ENST00000383767 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TREML2-201ENST00000483722 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CCT6P2-201ENST00000507234 1593 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ALDH7A1-227ENST00000636879 2501 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TFF1-201ENST00000291527 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IL36G-202ENST00000376489 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 BECN1P2-201ENST00000407947 812 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC097713.1-201ENST00000418025 562 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TISP43-205ENST00000440359 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL160408.4-201ENST00000441360 933 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL133387.3-201ENST00000450669 522 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL392003.2-201ENST00000451015 679 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC00894-207ENST00000452864 750 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CFL1P5-201ENST00000508046 502 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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