Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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Ccl20O89093 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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Ccl20O89093 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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