Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpreP49446 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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PtpreP49446 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtpreP49446 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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