Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vstm4T1NXB5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms