Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms