Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp2Q9Z0E6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp2Q9Z0E6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms