Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nrf1Q9WU00 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrf1Q9WU00 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms